MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Neisseria meningitidis M01-240355 chromosome

Total Repeats: 9274

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017517	CTGC	2	8	2389	2396	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017517	CGC	2	6	2461	2466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_017517	A	6	6	2495	2500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017517	TTA	2	6	3539	3544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017517	CCCG	2	8	4157	4164	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_017517	GCC	2	6	4286	4291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017517	CCT	2	6	4305	4310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017517	CAA	2	6	5949	5954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017517	CA	3	6	6218	6223	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017517	T	6	6	6262	6267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017517	TGG	2	6	8806	8811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017517	A	7	7	8969	8975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017517	T	6	6	8997	9002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017517	TGG	2	6	9011	9016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017517	GCT	2	6	9059	9064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017517	ATTTA	2	10	13455	13464	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017517	T	6	6	13518	13523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017517	TAAA	2	8	13570	13577	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017517	ATA	2	6	13591	13596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017517	GAT	2	6	13601	13606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017517	T	8	8	13639	13646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017517	ATC	2	6	13656	13661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017517	T	8	8	13670	13677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017517	GAA	2	6	13732	13737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017517	TGT	2	6	13760	13765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017517	GT	3	6	13847	13852	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017517	GTG	2	6	13938	13943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017517	A	6	6	13945	13950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017517	TCAG	2	8	13980	13987	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017517	TAAA	2	8	14010	14017	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017517	CGA	2	6	14066	14071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017517	CCA	2	6	14193	14198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_017517	TGT	2	6	14328	14333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017517	CGG	2	6	14368	14373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017517	TCA	2	6	14417	14422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017517	A	6	6	14436	14441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017517	TCG	2	6	14493	14498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017517	CCTG	2	8	14551	14558	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017517	ATCC	2	8	14573	14580	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017517	AAC	2	6	14691	14696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017517	T	6	6	14781	14786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017517	ATG	2	6	14799	14804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017517	A	6	6	14832	14837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017517	AAT	2	6	15804	15809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017517	CGA	2	6	15924	15929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017517	CCTC	2	8	15935	15942	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
47	NC_017517	A	6	6	15954	15959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017517	AGC	2	6	16095	16100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017517	TCG	2	6	16298	16303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017517	GC	3	6	16415	16420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017517	GGC	2	6	16448	16453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017517	CGAT	2	8	16482	16489	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017517	AT	3	6	16488	16493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017517	CCA	2	6	16499	16504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_017517	GCCT	2	8	16519	16526	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017517	ATTT	2	8	16593	16600	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017517	GGAAA	2	10	17152	17161	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017517	TTG	2	6	17214	17219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017517	TAT	2	6	17231	17236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017517	TTTTA	2	10	17304	17313	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017517	TTTC	2	8	17317	17324	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017517	T	6	6	17359	17364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017517	GGGT	2	8	17505	17512	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017517	TGGG	2	8	17513	17520	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017517	AATTT	2	10	17529	17538	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017517	GTG	2	6	17581	17586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017517	CCG	2	6	17612	17617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_017517	ATGG	2	8	17740	17747	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017517	ATG	2	6	18108	18113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017517	CCG	2	6	18158	18163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_017517	TCG	2	6	18651	18656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017517	ATG	2	6	18769	18774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017517	CCG	2	6	18819	18824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_017517	TCG	2	6	18853	18858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017517	GTT	2	6	19208	19213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017517	TGT	2	6	19732	19737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017517	GGAT	2	8	19804	19811	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017517	ATG	2	6	20451	20456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017517	CCGCT	2	10	20496	20505	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
80	NC_017517	ATG	2	6	21280	21285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017517	A	6	6	21313	21318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017517	CCG	2	6	21330	21335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_017517	TCG	2	6	22300	22305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017517	GGT	2	6	22429	22434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017517	CAG	2	6	22448	22453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017517	ATC	2	6	22458	22463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017517	TGG	3	9	22499	22507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017517	GGC	2	6	22515	22520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017517	GTC	2	6	22530	22535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017517	GGC	2	6	22539	22544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017517	GC	4	8	22543	22550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017517	T	6	6	22611	22616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017517	G	7	7	22716	22722	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017517	CGG	2	6	22732	22737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017517	TGAT	2	8	23182	23189	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017517	ACC	2	6	23242	23247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_017517	TGT	2	6	23269	23274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017517	TGT	2	6	23295	23300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017517	GGA	2	6	24168	24173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017517	GGGA	2	8	24241	24248	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017517	AGG	2	6	24286	24291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017517	GCC	2	6	24314	24319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_017517	ATG	2	6	24613	24618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017517	ATG	2	6	24660	24665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017517	CCG	2	6	24710	24715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_017517	GGT	2	6	24873	24878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017517	ATC	2	6	24902	24907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017517	GTC	2	6	24944	24949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017517	GGC	3	9	24962	24970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017517	CGGTGG	2	12	24976	24987	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_017517	T	6	6	25064	25069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017517	GTT	2	6	25082	25087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017517	TTG	2	6	25481	25486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017517	TGTT	2	8	25571	25578	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017517	T	7	7	25590	25596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017517	CGA	2	6	25656	25661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017517	ACG	2	6	25785	25790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017517	CAT	2	6	25910	25915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017517	GGA	2	6	25939	25944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017517	TATT	2	8	25985	25992	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017517	TAAA	2	8	26000	26007	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017517	T	6	6	27043	27048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017517	CGG	2	6	29224	29229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017517	A	8	8	31095	31102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017517	GGCTTG	2	12	31189	31200	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_017517	A	7	7	31204	31210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017517	CTG	3	9	31258	31266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017517	A	11	11	31302	31312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017517	CTCG	2	8	31320	31327	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017517	GCC	2	6	31895	31900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_017517	CGGG	2	8	31934	31941	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017517	T	6	6	31956	31961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017517	TCG	2	6	32150	32155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017517	TAA	2	6	33639	33644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017517	GCG	2	6	33660	33665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017517	CCG	2	6	33726	33731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_017517	CG	3	6	33730	33735	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017517	ATA	2	6	33791	33796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017517	TAT	2	6	33797	33802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017517	TCA	2	6	33803	33808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017517	GTTC	2	8	33814	33821	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017517	GGC	2	6	35855	35860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017517	GCCTT	2	10	35916	35925	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_017517	TCG	2	6	35953	35958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017517	AT	3	6	35995	36000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017517	GCAGG	2	10	36002	36011	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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292	NC_017517	TCGTG	2	10	62296	62305	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
293	NC_017517	CAT	2	6	62355	62360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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422	NC_017517	TATAAG	2	12	80704	80715	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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424	NC_017517	ATTT	2	8	80760	80767	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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428	NC_017517	A	6	6	88112	88117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
429	NC_017517	AATT	2	8	88153	88160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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